UF2078 Extracción, Amplificación, Secuenciación y Caracterización de Ácidos Nucleicos, Proteínas y Otros Metabolitos Aplicando Técnicas de Biología Molecular

OBJETIVOS

En el ámbito del mundo de la química es necesario conocer los diferentes campos en el análisis biotecnológico, dentro del área profesional de análisis y control. Así, con el presente curso se pretende aportar los conocimientos necesarios para la extracción, amplificación, secuenciación y caracterización de ácidos nucleicos, proteínas y otros metabolitos aplicando técnicas de biología molecular.

CONTENIDO

UNIDAD FORMATIVA 1. EXTRACCIÓN, AMPLIFICACIÓN, SECUENCIACIÓN Y CARACTERIZACIÓN DE ÁCIDOS NUCLEICOS, PROTEÍNAS Y OTROS METABOLITOS APLICANDO TÉCNICAS DE BIOLOGÍA MOLECULAR

UNIDAD DIDÁCTICA 1. APLICAR TÉCNICAS GENERALES DE BIOLOGÍA MOLECULAR EN ANÁLISIS BIOTECNOLÓGICO

1. Electroforesis: fundamentos, tipos mono y bidimensional:
2. - Preparación de geles
3. - Revelado de bandas de cadenas
4. - Clasificación y almacenamiento de los residuos electroforéticos
5. - Procesado y registro de imágenes
6. Análisis de imágenes de geles
7. Espectroscopia de visible, UV, IR.
8. Espectroscopia de fluorescencia molecular
9. Espectrofotometría de masas
10. Cromatografía -columna flash, TLC y HPLC-
11. - Tipos de rellenos de columnas cromatográficas -resinas de absorción y adsorción, gel de sílice fase normal y fase reversa, intercambio iónico, cribado molecular
12. Conceptos básicos de resonancia magnética nuclear
13. Tecnología de alto rendimiento-high throughput- en genómica, proteómica y metabolómica

UNIDAD DIDÁCTICA 2. CONCEPTOS GENERALES DE ÁCIDO NUCLEICO

1. Bases nitrogenadas
2. Estructura y función de ADN y ARN
3. Replicación
4. Desnaturalización ADN
5. Conceptos de gen, operones, promotores y secuencias consenso
6. Genomas y cromosomas

UNIDAD DIDÁCTICA 3. APLICAR LAS SECUENCIAS MARCADAS EN LOS PROCEDIMIENTOS ESTABLECIDOS PARA AISLAR ÁCIDOS NUCLEICOS, PROTEÍNAS Y OTROS METABOLITOS

1. Extracción, purificación y análisis espectroscópico y/o electroforético de ADN y ARN
2. Amplificación por PCR
3. Programación del termociclador con temperaturas, tiempos y ciclos preestablecidos
4. Concepto de PCR a tiempo real
5. Determinación de tamaño y mapas de restricción
6. Visualización de geles

UNIDAD DIDÁCTICA 4. UTILIZACIÓN DE TÉCNICAS GENÓMICAS APLICABLES EN ANÁLISIS BIOTECNOLÓGICO

1. Análisis de genomas:
2. - Secuencias automáticas y construcción de contigs: phred-phrap-consed
3. - Anotación de genomas: métodos y estrategias. Anotación automatizada vs anotación manual
4. - Recursos online: ENSEMBL, NCBI, UCSC, TIGR
5. Taxonomía microbiana molecular por secuenciación parcial de genes ribosomales
6. Análisis de secuencias
7. Elaboración de dendogramas y filogenias
8. Clonación: concepto, vectores y enzimas de restricción, ligación y expresión
9. Hibridaciones Northern -ARN- y Southern -ADN-
10. Hibridación in situ
11. Huella genética «DNA Fingerprinting»:
12. - Concepto y aplicaciones
13. Cluster de genes de biosíntesis de metabolitos secundarios:
14. - Nociones y aplicación
15. Tecnología de Microarrays y Chips de ADN y ARN:
16. - Concepto y aplicaciones

UNIDAD DIDÁCTICA 5. CONCEPTOS GENERALES DE PROTEÍNAS

1. Definición
2. Aminoácidos
3. Estructura, conformación y función de proteínas
4. Clasificación de proteínas en base a secuencia. Bases de datos: Pfam, PROSITE, ProDom, SMART, InterPro, COGs
5. Predicción de estructura secundaria
6. Alineamientos estructurales
7. Clasificación estructural: bases de datos: SCOP, CATH, FSSP
8. Predicción de estructura terciaria. Modelado
9. Transcripción y traducción

UNIDAD DIDÁCTICA 6. UTILIZACIÓN DE TÉCNICAS PROTEÓMICA APLICABLES EN ANÁLISIS BIOTECNOLÓGICO

1. Extracción de proteínas desde biomasa microbiana o celular:
2. - Técnicas y seguimiento
3. Purificación y análisis por espectroscopia de masas y electroforesis bidimensional tipo SDS-PAGE
4. Detección de proteínas por «Western blot», ELISA, técnicas inmunohistoquímicas
5. Proteínas recombinantes: Tecnología y aplicación
6. Nociones sobre tipos de dianas proteicas más relevantes empleados en cribado-screening

UNIDAD DIDÁCTICA 7. APLICAR NORMAS DE SEGURIDAD Y DE PROTECCIÓN AMBIENTAL

1. Buenas prácticas de procesos y de laboratorio
2. Procedimientos escritos normalizados sobre seguridad
3. Manuales de uso de los equipos
4. Equipos de protección individual
5. Manual de uso de los equipos de prevención y respuesta a la emergencia
6. Legislación y normativa sobre biotecnología
7. Documentación necesaria para la utilización de los productos y/o servicios biotecnológicos resultantes

MATERIAL INCLUIDO EN LA MODALIDAD A DISTANCIA

• Manual teórico: UF2078 Extracción, Amplificación, Secuenciación y Caracterización de Ácidos Nucleicos, Proteínas Y Otros Metabolitos Aplicando Técnicas De Biología Molecular
• Cuaderno de ejercicios: UF2078 Extracción, Amplificación, Secuenciación y Caracterización de Ácidos Nucleicos, Proteínas Y Otros Metabolitos Aplicando Técnicas De Biología Molecular